Metabolomika

• Cilj predmeta je predstaviti napredne analizne tehnologije z aplikacijo v rastlinskih eksperimentih.
• Namen predmeta je pridobitev novega znanja ter razširitev znanja pridobljenega pri drugih predmetih z uporabo modernih analiznih metodologij, ki celostno opišejo metabolno stanje v rastlinah in mikroorganizmih ter njihove interakcije.

/

Predmet bo zajemal sledeče vsebine:
* Opis metaboloma
* Priprava eksperimentalne zasnove s poudarkom na sistemski variabilnosti
* Priprava vzorcev rastlinskih in živilskih materialov
* Analizne metode v metabolomiki
* Obdelava podatkov ter univariantna in multivariantna statistična analiza
* Potrjevanje identifikacije metabolitov
* Identifikacija (novih) neznanih metabolitov
* Umeščanje metabolitov v biosintezne poti
* Tarčne analize specifičnih biosinteznih poti
* Uporaba stabilnih izotopov za sledenje biosinteznih poti
* Metabolomske študije na rastlinskih modelih, modelih v vinogradništvu in vinarstvu
* Integracija metabolomike z ostalimi »omics« metodologijami kot so genomika, transkriptomika in proteomika.

Znanje in razumevanje
* Metabolnih procesov v rastkini ter poznavanje orodij za njihovo ovrednotenje
* Uporaba.
* Predstavitev raziskav v delu.
* Refleksija.
* Zmožnost razumevanja analiznih metodologij in njihova uporaba z prenosom v farmacevsko, nutricionistično, biotehnološko in biomedicinsko prakso.
* Prenosljive spretnosti.
* Uporaba nove literature raziskav ter razvijajočih se baz podatkov in platform za obdelavo podatkov in interpretacijo rezultatov.

• The HANDBOOK of metabonomics and metabolomics edited by John C. Lindon, Jeremy K. Nicholson and Elaine Holmes. - 1st ed. Amsterdam ; Oxford : Elsevier, 2007. - 1 online resource (x, 561 p.) : ill. (some col.), ISBN 978-0-444-52841-4 Katalog
• GENOMICS, proteomics, and metabolomics in nutraceuticals and functional foods / editors, Debasis Bagchi, Francis C. Lau, Manashi Bagchi. - Ames (Iowa) : Wiley-Blackwell, cop. 2010. - XIV, 338 str., 16 str. ISBN 978-0-8138-1402-5 E-gradivo
• METABOLOMICS in practice : successful strategies to generate and analyze metabolic data / edited by Michael Lämmerhofer and Wolfram Weckwerth. - Weinheim : Wiley-VCH, cop. 2013. - XXV, 415 str. ISBN 978-3-527-65589-2 Katalog
• NUTRITIONAL genomics : discovering the path to personalized nutrition / edited by Jim Kaput and Raymond L. Rodriguez. - Hoboken (New Jersey) : Wiley-Interscience, cop. 2006. - XXV, 469 str. ISBN 0-471-68319-1 E-gradivo
• PLANT metabolomics : methods and protocols / edited by Nigel W. Hardy, Robert D. Hall. - New York : Humana Press : Springer, cop. 2012. - XIII, 340 str. ISBN 978-1-61779-593-0 Katalog
• Slides
• Moodle učilnica z pripravljenimi e-viri

Diskusiji z nosilcem predmeta in ostalimi študenti (50%), Ustni izpit (50%)

Docent za področje Kemija na UNG.