Metode biostatistične analize

Osnovni cilj predmeta Metode biostatistične analize je podati znanje o statističnih metodah, potrebnih za odkrivanje značilnosti posameznih elementov naravnih sistemov (biološki in ekološki sistemi), njihovih medsebojnih odnosov ter vzajemnih odnosov z dejavniki okolja, kar predstavlja osnovna izhodišča raziskovalnega dela za večino področij znanosti o okolju. Predmet obravnava potrebne statistično-metodološke korake za odkrivanje vpliva splošnih dejavnikov na elemente naravnih sistemov, podaja metode za odkrivanje različnih oblik povezav med posameznimi dejavniki oz. elementi kakor tudi metode za preverjanje hipotez. V okviru predmeta študent pridobi osnovna znanja za izdelavo statistčnih analiz in razvije sposobnost kritičnega interpretiranja biostatistčnih rezultatov.

Biostatistična analiza se navezuje na splošno statistiko, matematiko ter biološke in ekološke predmete prve stopnje študija.

• Masovni pojavi
• Elementarni parametri
• Relativna števila
• Kvantili
• Srednje vrednosti
• Mere variacije, asimitrije in sploščenosti
• Teoretične porazdelitve
• Vzorčenje, ocenjevanje parametrov
• Vzorčenje, mali vzorci
• Preizkušanje hipotez
• Asociacija in kontingenca
• Korelacija in regresija
• Analiza kovariance
• Preučevanje dinamike pojavov
• Klasifikacija
• Ordinacija
• Statistično načrtovanje poskusov

Znanje in razumevanje:

Do konca tega predmeta bo študent:
• poznal statistične metode za raziskovanje naravnih sistemov,
• znal pojasniti rezultate enostavnih biostatističnih analiz,
• poznal metode za preverjanje hipotez,
• pridobil znanja o osnovnih metodah načrtovanja, poskusov pri proučevanju vplivov okolja na sisteme.

• Zar, J. H. 1999. Biostatistical Analysis. Fourth Edition. New Jersey, Prentice Hall: 663 str. E-gradivo
• Ludwig, J. A., Reynolds, J. F. 1988. Statistical Ecology. New York, Chichester, Brisbane, Toronto, Singapore, John Wiley & Sons: 337 str.E-gradivo

Pisni izpit (100 %)

Docentka za področje biokemije na Univerzi v Novi Gorici

1. LINDIČ, Nataša, BUDIČ, Maruška, PETAN, Toni, KNISBACHER, Binyamin A., LEVANON, Erez Y., LOVŠIN, Nika. Differential inhibition of LINE1 and LINE2 retrotransposition by vertebrate AID/APOBEC proteins. Retrovirology, ISSN 1742-4690. Online ed., 2013, vol. 10, art. no. 156, str. 1-16. http://www.retrovirology.com/content/pdf/1742-4690-10-156.pdf. [COBISS.SI-ID 27367975]
2. LOVŠIN, Nika, PETERLIN, Matija Boris. APOBEC3 proteins inhibit LINE-1 retrotransposition in the absence of ORF1p binding. V: Natural genetic engineering and natural genome editing : proceedings of the GenConText Research Symposium, 3-6 July 2008, Salzburg, Austria, (Annals of the New York Academy of Sciences, ISSN 0077-8923, vol. 1178, no. 1, 2009). New York: New York Academy of Sciences, 2009, vol. 1178, no. 1, str. 268-275. [COBISS.SI-ID 23252263]
   tipologija 1.08 -> 1.01
3. AGUIAR, Renato S., LOVŠIN, Nika, TANURI, Amilcar, PETERLIN, Matija Boris. VPR.A3A chimera inhibits HIV replication. The Journal of biological chemistry, ISSN 0021-9258, 2008, vol. 283, no. 5, str. 2518-2525, ilustr. [COBISS.SI-ID 21302823]
4. OKEOMA, Chioma M., LOVŠIN, Nika, PETERLIN, Matija Boris, MARKI, Susan Ross. APOBEC3 inhibits mouse mammary tumour virus replication in vivo. Nature, ISSN 0028-0836, 2007, vol. 445, no. 7130, str. 927-930. [COBISS.SI-ID 20903975]
5. LOVŠIN, Nika, GUBENŠEK, Franc, KORDIŠ, Dušan. Evolutionary dynamics in a novel L2 clade of non-LTR reprotransposons in Deuterostomia. Molecular biology and evolution, ISSN 0737-4038, 2001, vol. 18, str. 2213-2224. [COBISS.SI-ID 16295719]